Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Afg3l1Q920A7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Afg3l1Q920A7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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