Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms