Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Nek8Q91ZR4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Nek8Q91ZR4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Nek8Q91ZR4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Nek8Q91ZR4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Nek8Q91ZR4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Nek8Q91ZR4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Nek8Q91ZR4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek8Q91ZR4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms