Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc49Q91YK0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms