Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms