Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Snx15Q91WE1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Snx15Q91WE1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snx15Q91WE1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snx15Q91WE1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snx15Q91WE1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snx15Q91WE1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms