Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms