Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms