Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps3Q91VB4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms