Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms