Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms