Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul7Q8VE73 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms