Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE62

Paip1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip1Q8VE62 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Paip1Q8VE62 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Paip1Q8VE62 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Paip1Q8VE62 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Paip1Q8VE62 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Paip1Q8VE62 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Paip1Q8VE62 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms