Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Smg8Q8VE18 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Smg8Q8VE18 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Smg8Q8VE18 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Smg8Q8VE18 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Smg8Q8VE18 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms