Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms