Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ApobrQ8VBT6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ApobrQ8VBT6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ApobrQ8VBT6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ApobrQ8VBT6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ApobrQ8VBT6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ApobrQ8VBT6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ApobrQ8VBT6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ApobrQ8VBT6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ApobrQ8VBT6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ApobrQ8VBT6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ApobrQ8VBT6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ApobrQ8VBT6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms