Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms