Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N0

Ccdc59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc59Q8R2N0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc59Q8R2N0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms