Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Impg1Q8R1W8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Impg1Q8R1W8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Impg1Q8R1W8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Impg1Q8R1W8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Impg1Q8R1W8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Impg1Q8R1W8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Impg1Q8R1W8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Impg1Q8R1W8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Impg1Q8R1W8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Impg1Q8R1W8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Impg1Q8R1W8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms