Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4E0

Alms1, Alstrom syndrome protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alms1Q8K4E0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alms1Q8K4E0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alms1Q8K4E0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alms1Q8K4E0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alms1Q8K4E0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alms1Q8K4E0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms