Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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