Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms