Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk5rap2Q8K389 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms