Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms