Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl47Q8K2Y7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms