Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrdQ8K2M3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms