Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms