Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gtf3c1Q8K284 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gtf3c1Q8K284 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gtf3c1Q8K284 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gtf3c1Q8K284 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gtf3c1Q8K284 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gtf3c1Q8K284 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gtf3c1Q8K284 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gtf3c1Q8K284 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gtf3c1Q8K284 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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