Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Neil3Q8K203 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Neil3Q8K203 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms