Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms