Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms