Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms