Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms