Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms