Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG7

Rapgef2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef2Q8CHG7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef2Q8CHG7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef2Q8CHG7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms