Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Arhgap29Q8CGF1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Arhgap29Q8CGF1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Arhgap29Q8CGF1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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