Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd1bQ8CFT2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms