Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ercc8Q8CFD5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ercc8Q8CFD5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ercc8Q8CFD5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ercc8Q8CFD5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ercc8Q8CFD5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ercc8Q8CFD5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ercc8Q8CFD5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ercc8Q8CFD5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ercc8Q8CFD5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ercc8Q8CFD5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ercc8Q8CFD5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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