Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms