Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms