Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms