Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc63Q8CDV6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms