Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc9Q8CDN9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc9Q8CDN9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc9Q8CDN9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc9Q8CDN9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc9Q8CDN9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc9Q8CDN9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc9Q8CDN9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc9Q8CDN9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms