Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Lrif1Q8CDD9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Lrif1Q8CDD9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Lrif1Q8CDD9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Lrif1Q8CDD9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrif1Q8CDD9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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