Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms