Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms