Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Spef2Q8C9J3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spef2Q8C9J3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms