Protein–RNA interactions for Protein: Q8C850

Scara3, Scavenger receptor class A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara3Q8C850 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scara3Q8C850 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara3Q8C850 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms