Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms