Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C1R3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms